Το σημαντικότερο αξιοθέατο του νησιού αποτελεί ο περίφημος κρατήρας «Στέφανος», το ενεργό ηφαίστειο που προέκυψε από δύο μεγάλες υποθαλάσσιες εκρήξεις πριν από 25.000 και 15.000 χρόνια. Ανακαλύψτε το μυστηριακό αυτό τοπίο, με την έντονη μυρωδιά από θειάφι, καθώς περπατάτε γύρω και εντός του κρατήρα με τα λευκά και κίτρινα χρώματα και τις τρύπες που κοχλάζουν κάτω από τα πόδια σας.
Επισκεφθείτε το γραφικό Μανδράκι, την πρωτεύουσα του νησιού, με τα πλακόστρωτα σοκάκια, τις βοτσαλωτές πλατείες και τα λευκά σπίτια με τα πολύχρωμα παράθυρα. Δώστε ραντεβού στην πλατεία Ηλικιωμένης με τους χαρακτηριστικούς φύκους και θαυμάστε το διώροφο νεοκλασικό του Δημαρχείου, κτισμένο το 1931 από μάστορες της γειτονικής Σύμης.
Η Νίσυρος φημίζεται για τις ιαματικές πηγές της, που προσφέρονται για θεραπευτική υδροθεραπεία. Στα 1500 μέτρα από την πρωτεύουσα του νησιού βρίσκονται τα ανακαινισμένα Δημοτικά Λουτρά Μανδρακίου, όπου τα νερά της θερμής πηγής φτάνουν σε θερμοκρασία 46° C.
Ανεβείτε ως τη Μονή της Παναγίας Σπηλιανής (17ος αιώνας), που στέκει στον 30 μέτρων ύψους βράχο του ενετικού κάστρου των Ιπποτών στο Μανδράκι. Τα 270 σκαλοπάτια που οδηγούν στην ιερή Σπηλιά της εκκλησίας θα σας ανταμείψουν, μιας και εκεί θα δείτε το περίτεχνο ξυλόγλυπτο τέμπλο του 1725 και τη θαυματουργή εικόνα της Παναγίας.
Στο χωριό Νικειά παρατηρήστε την πλατεία Πόρτα, γνωστή για το ελλειψοειδές της σχήμα, με περίτεχνη βοτσαλωτή διακόσμηση που χρονολογείται από το 1923 (δια χειρός του φημισμένου ντόπιου τεχνίτη Πασχάλη Πασχαλάκη). Λίγα μέτρα πάνω από την πλατεία, ξεχωρίζει η εντυπωσιακή εκκλησία των Εισοδίων της Θεοτόκου. Στη Νικειά βρίσκεται και το μοναδικό στην Ελλάδα Ηφαιστειολογικό Μουσείο.
Μην παραλείψετε μια επίσκεψη στο γραφικό ορεινό χωριό Εμπορειό, η ξεχωριστή αρχιτεκτονική του οποίου χαρακτηρίζεται από σπίτια κτισμένα από ηφαιστειακή πέτρα, καθώς και διώροφα νεοκλασικά με εντυπωσιακά υπέρθυρα. Από εδώ θα φτάσετε στο μεσαιωνικό Κάστρο της Παντονίκης με την εκκλησία των Ταξιαρχών (13ος αιώνας) για να θαυμάσετε το Αιγαίο και την καλντέρα του ηφαιστείου.
Στο Παλαιόκαστρο στέκει εδώ και 2.600 έτη η εξαιρετικά καλοδιατηρημένη ακρόπολη της Νισύρου, ένα από τα πιο μεγαλειώδη οχυρωματικά έργα του Αιγαίου, κτισμένη από στιβαρό μαύρο τραχείτη.
Η Νίσυρος προσφέρεται για πεζοπορικές διαδρομές, μέσα από τις οποίες μπορείτε να ανακαλύψετε τη φύση του νησιού διασχίζοντας ξερολιθιές (βαστάδια), πέτρινες αγροικίες (σπηλάδια), παλιά αποστακτήρια και ξωκλήσια. Ένα βατό μονοπάτι, διάρκειας μιας ώρας, που θα σας ανταμείψει με μοναδική θέα στο Αιγαίο, είναι εκείνο που ξεκινάει από το μοναστήρι της Ευαγγελίστριας και φτάνει στο ψηλότερο σημείο του νησιού (698 μέτρα), τον Προφήτη Ηλία.