Οχυρωμένη πίσω από θεόρατα πολυγωνικά τείχη, στο ψηλότερο σημείο της Χώρας, στέκεται επιβλητική από τον 11ο αιώνα η Μονή Αγίου Ιωάννη Θεολόγου. Σύμβολο της Πάτμου, η μοναστική καστροπολιτεία αποτελεί, μαζί με το Ιερό Σπήλαιο της Αποκάλυψης, ορόσημο για την ιστορική εξέλιξη του νησιού. Περιηγηθείτε στις αυλές με τα τοξωτά περάσματα πριν επισκεφτείτε το Καθολικό, τα παρεκκλήσια, την Τράπεζα, το εκκλησιαστικό μουσείο και τη βιβλιοθήκη με τους ανεκτίμητους θησαυρούς και τα σπάνια χειρόγραφα. Το σπήλαιο όπου ασκήτεψε ο Ευαγγελιστής Ιωάννης και του φανερώθηκε το 95 μ.Χ. το ιερό βιβλίο της Αποκάλυψης, βρίσκεται στο μέσο της διαδρομής από την Χώρα στο λιμάνι. Σήμερα αποτελεί μέρος ενός μοναστικού συμπλέγματος με πολλά παρεκκλήσια, κελιά και αποθήκες.
Γύρω από την Μονή του Αγίου Ιωάννη του Θεολόγου απλώνεται η ατμοσφαιρική Χώρα της Πάτμου, ένα ολόλευκο κομψοτέχνημα αρχιτεκτονικής και καλαισθησίας. Περιπλανηθείτε στα δαιδαλώδη λιθόστρωτα στενά με τα πέτρινα θολωτά περάσματα, σταθείτε να θαυμάσετε τα πανέμορφα αρχοντικά του 16ου – 17ου αιώνα με τα περίτεχνα «μαντώματα» (διακοσμητικές πέτρες) στις πόρτες και τα παράθυρα. Απαραίτητοι σταθμοί της περιπλάνησης, η γραφική πλατεία Αγίας Λεβιάς, το νεοκλασικό Δημαρχείο (στην πλατεία Ξάνθου), η συνοικία Απορθιανά με τα καπετανόσπιτα του 19ου αιώνα (σύμβολα της μεγάλης ναυτιλιακής και εμπορικής δύναμης των Πατμιανών) και οι τρεις επιβλητικοί ανεμόμυλοι (17ος – 19ος αι.) του νησιού, βραβευμένοι με το Europa Nostra (2010) για την υποδειγματική τους αναπαλαίωση. Για όσους επιθυμούν να εντρυφήσουν στον πατμιακό τρόπο ζωής, αξίζει μια επίσκεψη στο Αρχοντικό Σημαντήρη (1625), το παλαιότερο στη Χώρα. Ένα ζωντανό μουσείο της ιστορίας του τόπου μέσα από διακόσμηση εποχής και εντυπωσιακά κειμήλια.
Η καρδιά του νησιού χτυπά στη Σκάλα, το μοναδικό λιμάνι του νησιού με πλήθος εμπορικών καταστημάτων και επιλογών ψυχαγωγίας. Από εδώ, ανεβείτε στον λόφο του Καστελλίου για να θαυμάσετε τα εκθαμβωτικά ερείπια της αρχαίας ακρόπολης της Πάτμου. Η τοποθεσία προσφέρει μαγευτική θέα στην Νάξο και την Ικαρία, τη Χώρα και τον κόλπο της Σκάλας, καθώς και το ωραιότερο ηλιοβασίλεμα του νησιού.